研究テーマ
　　　1. 水圏生物ゲノムの構成と解析・技術開発、高精度ゲノムマップ作成
　　　2. 水圏生物有用形質の連鎖解析・相関解析および選抜育種
　　　3. 魚類ノンコーディングRNAの機能解析
　　　4. イルカ類における特徴的な遺伝子の比較ゲノム解析
　　　5. 水圏生物バイオテクノロジー
　　　6. 魚類等を用いた行動学的研究(予定)
　　　7. タンパク質の構造―機能連関

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　水圏生物ゲノムの構成と解析・技術開発、高精度ゲノムマップ作成
　　　進行中：トラフグ・メダカ・ニジマス・好熱性細菌・イルカ
　　　予定　：各種フグ・タコ・エビ・アコヤガイ・ウナギ・ヒラメ・マダイ・ティラピア・
　　　　　　　チョウザメ・各種プランクトン
　　　①各種BAC/フォスミドゲノムライブラリーの作製
　　　②シーケンシングデータ高精度アセンブルアルゴリズムの開発

 

　水圏生物有用形質の連鎖解析・相関解析および選抜育種
　　　①ニジマス高温耐性遺伝子の探索と育種
　　　②フグ高成長関連遺伝子の探索と育種
　　　③各種魚介類性決定遺伝子等の探索

 

　魚類ノンコーディングRNAの機能解析
　　　①次世代シーケンサによるメダカ・フグ小分子RNAのトランスクリプトーム
　　　②魚類における小分子RNAの機能の解析
　　　③筋発生・成長における小分子RNAの機能解析

 

　イルカ類における特徴的な遺伝子の比較ゲノム解析
　　　①味覚関連遺伝子の構造解析
　　　②毛髪関連遺伝子の構造解析
　　　③腹ビレイルカにおける腹ビレ形成原因遺伝子の探索

 

　水圏生物バイオテクノロジー
　　　①各種実験系のための各種水圏生物単為発生個体の作出
　　　②高成長養殖技術に関する基礎研究
　　　③水産魚種ミオスタチン遺伝子ノックアウト個体などの試験的作製（予定）

 

　魚類等を用いた行動学的研究(予定)
　　　①記憶、学習、情報伝達などに関する研究

 

　タンパク質の構造―機能連関
　　　①変異体の作製と安定性解析
　　　②分子シミュレーション